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http://rid.unrn.edu.ar/handle/20.500.12049/8366
Título: | Modelling diagnostics for Echinococcus granulosus surveillance in sheep using Latent Class Analysis: Argentina as a case study |
Autor(es): | Sykes, Abagael Larrieu, Edmundo Poggio, Veronica Cespedes, Graciela Mujica, Guillermo Basanez, Maria Gloria Prada, Joaquin |
Fecha de publicación: | 4-jun-2022 |
Editorial: | Elsevier |
Citación: | Sykes AL, Larrieu E, Poggio TV, Céspedes MG, Mujica GB, Basáñez MG, Prada JM. (2022). diagnostics for Echinococcus granulosus surveillance in sheep using Latent Class Analysis: Argentina as a case study. One Health. 14; 100359. |
Revista: | Ona Health |
Abstract: | Echinococcus granulosus sensu lato is a globally prevalent zoonotic parasitic cestode leading to cystic echinococcosis (CE) in both humans and sheep with both medical and financial impacts, whose reduction requires the application of a One Health approach to its control. Regarding the animal health component of this approach, lack of accurate and practical diagnostics in livestock impedes the assessment of disease burden and the implementation and evaluation of control strategies. We use of a Bayesian Latent Class Analysis (LCA) model to estimate ovine CE prevalence in sheep samples from the Río Negro province of Argentina accounting for uncertainty in the diagnostics. We use model outputs to evaluate the performance of a novel recombinant B8/2 antigen B subunit (rEgAgB8/2) indirect enzyme-linked immunosorbent assay (ELISA) for detecting E. granulosus in sheep. Necropsy (as a partial gold standard), western blot (WB) and ELISA diagnostic data were collected from 79 sheep within two Río Negro slaughterhouses, and used to estimate individual infection status (assigned as a latent variable within the model). Using the model outputs, the performance of the novel ELISA at both individual and flock levels was evaluated, respectively, using a receiver operating characteristic (ROC) curve, and simulating a range of sample sizes and prevalence levels within hypothetical flocks. The estimated (mean) prevalence of ovine CE was 27.5% (95%Bayesian credible interval (95%BCI): 13.8%–58.9%) within the sample population. At the individual level, the ELISA had a mean sensitivity and specificity of 55% (95%BCI: 46%–68%) and 68% (95%BCI: 63%–92%), respectively, at an optimal optical density (OD) threshold of 0.378. At the flock level, the ELISA had an 80% probability of correctly classifying infection at an optimal cut-off threshold of 0.496. These results suggest that the novel ELISA could play a useful role as a flock-level diagnostic for CE surveillance in the region, supplementing surveillance activities in the human population and thus strengthening a One Health approach. Importantly, selection of ELISA cut-off threshold values must be tailored according to the epidemiological situation |
Resumen: | Echinococcus granulosus sensu lato es un cestodo parasitario zoonótico de prevalencia mundial que causa equinococosis quística (EC) tanto en humanos como en ovejas con impactos médicos y financieros, cuya reducción requiere la aplicación de un enfoque de One Health para su control. Con respecto al componente de salud animal de este enfoque, la falta de diagnósticos precisos y prácticos en el ganado impide la evaluación de la carga de la enfermedad y la implementación y evaluación de estrategias de control. Usamos un modelo Bayesiano de Análisis de Clase Latente (LCA) para estimar la prevalencia de CE ovina en muestras de ovinos de la provincia de Río Negro de Argentina teniendo en cuenta la incertidumbre en el diagnóstico. Utilizamos los resultados del modelo para evaluar el rendimiento de un nuevo B8/2 recombinante subunidad del antígeno B (rEgAgB8/2) ensayo inmunoabsorbente ligado a enzimas indirecto (ELISA) para detectar E. granulosus en ovejas Los datos de diagnóstico de necropsia (como estándar de oro parcial), western blot (WB) y ELISA se recopilaron de 79 ovejas dentro de dos mataderos de Río Negro, y se utilizó para estimar el estado de infección individual (asignado como variable latente dentro del modelo). Utilizando los resultados del modelo, se evaluó el rendimiento del nuevo ELISA a nivel individual y de parvada, respectivamente, utilizando una curva característica operativa del receptor (ROC), y simular un rango de tamaños de muestra y niveles de prevalencia dentro de bandadas hipotéticas. La (media) estimada la prevalencia de EC ovina fue del 27,5 % (95 % intervalo creíble bayesiano (95 % BCI): 13,8 %–58,9 %) dentro de la muestra población. A nivel individual, el ELISA tuvo una sensibilidad y especificidad medias del 55% (95%BCI: 46%–68%) y 68 % (95 % BCI: 63 %–92 %), respectivamente, en un umbral óptimo de densidad óptica (OD) de 0,378. en el rebaño nivel, el ELISA tenía un 80% de probabilidad de clasificar correctamente la infección en un umbral de corte óptimo de 0,496. Estos resultados sugieren que el nuevo ELISA podría desempeñar un papel útil como diagnóstico a nivel de parvada para la vigilancia de CE en la región, complementando las actividades de vigilancia en la población humana y fortaleciendo así una Enfoque de salud. Es importante destacar que la selección de los valores de umbral de corte de ELISA debe adaptarse de acuerdo con la situación epidemiológica |
URI: | http://rid.unrn.edu.ar/handle/20.500.12049/8366 |
Identificador DOI: | https://doi.org/10.1016/j.onehlt.2021.100359 |
ISSN: | 2352-7714 |
Otros enlaces: | https://www.sciencedirect.com/science/article/pii/S235277142100149X |
Aparece en las colecciones: | Artículos |
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